복지부는 서울시의 경우 25개 구 가운데 14개구가 의사회를 제외한 상태에서 협력회의가 설치되고 부산은 16개구가 5월3일자로 구성이 완료됐다고 발표하고 있으나 서울의 경우 의사회 집행부가 의약분업과 관련한 의료계의 요구가 관철될 때 까지 분업협력회의 구성에 참여치 말도록 지시함으로써 의사회 측 인사가 참여하지 않고 있으며 부산의 경우도 금정, 서구, 남구 등 3개구만이 참여 서명한 상태로 회의는 실질적으로 한번도 이루어지지 않은 것으로 조사됐다.
복지부에서 전 자치구에서 완료됐다고 발표한 광주, 경상남도, 대구, 대전, 강원도, 충청북도, 전라북도, 경상북도의 경우도 지역보건소을 통해 이름만 제출해 놓은 정도며 핵심사항인 의약품목록제출 요청은 유보상태로 회의는 제대로 이루어지지 못한 상태다. 제주도, 그리고 충청남도의 경우 3군데에서 간담회 형식의 회의를 가진 것으로 알려졌으나 역시 의약품목록은 전혀 제출되지 않은 것으로 나타났다. 경기도의 경우도 평택을 제외한 31개 시군은 명단만 제출된 형식적인 구성에 지나지 않았으며 전라남도는 도의사회에서 이사 전원이 참여를 반대해 불참하고 있는 것으로 나타났다.
중앙의약분업협력회의는 의약품 분류가 선진국 수준을 전제로 하지 않는 한 불참을 선언하고 있어 앞으로 이 회의의 행보에 따라 참여 가부가 결정될 것으로 전망된다.
한편 복지부는 복지부장관 등이 이달 중순부터 각시도의사회을 돌며 의약분업 설명회를 가질 예정인데 대다수 지역의사회에서는 회원들의 정서상 이 설명회도 거부할 가능성이 크다고 밝히고 있어 난항이 예상된다.
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